Початок роботи з кластером.

Доступ до обчислювального кластера здійснюється за шляхом надання віддаленого терміналу. При кожному «заходженні» на кластер вас буде автоматично перенаправлено на один з робочих вузлів. Адреса кластера: grid.imbg.org.ua

Для доступу використовується протокол SSH (стандартний порт 22). Якщо ви користуєтесь операційною системою Linux – команда: slogin user@grid.imbg.org.ua, де user – ім’я акаунту користувача.

Для доступу з операційної системи MS Windows рекомендовано використовувати пакет PuTTY

Запуск програм.

Робота на кластері виконується виключно з використанням інтерфейсу командного рядка. Для ознайомлення командним рядком рекомендовано прочитати літературу з OC Linux, наприклад наступні джерела: Introduction to Linux - A Hands on Guide та GNU/Linux Command-Line Tools Summary.

Постановка задач на кластері, які вимагають довготривалого використання ресурсів і не можуть бути обрахованими в рамках інтерактиіної сессії, здійснюється виключно за допомогою використання диспетчеру задач Torque PBS. Детальніше з користуванням диспетчером задач можна ознайомитись на сайті розробників.

Для збереження тимчасових даних застосовується спільний ресурс, що підмонтовано в гілку /mnt/work файлової системи. Запуск завдань дозволяеться проводити тільки таким чином, щоб запис файлів відбувався саме в цю гілку. По завершенні розрахунку користувач повинен видалити непотрібні файли і перенести результат у домашній каталог. В протилежному випадку файли буде автоматично знищено через 2 тижні. Домашній каталог /home використовується для довготривалого збереження отриманих результутів.

Перехід на інший обчислювальний вузол.

Всі обчислювальні вузли кластера надають доступ до спільних ресурсів дискового простору підмонтованих в /home.

Локальний скретч для обчислень знаходиться в /mnt/work/ кожного робочого вузла, і доступний для всього кластеру за шляхом /net/node<номер вузла>/mnt/work

Таким чином незалежно від робочого вузла на якому ви знаходитесь ви можете отримати доступ до всіх ресурсів.

Якщо все ж таки виникла необхідність перейти на інший вузол, необхідно скористуватись командою: rsh nodeN, де nodeN ім’я бажаного вузла (наприклад node1)