Кластер ИМБГ НАН Украины построен на базе вычислительного узла класса beowulf, состоящим из 15 вычислительных узлов, двух управляющих и одного используемого под сетевые сервисы. Пользователям для расчетов доступны 360 процессорных ядер Intel® Xeon®. На каждом узле находятся по два 12-х ядерных процессора. Между собой узлы связаны Gigabit Ethernet и Infiniband.
Объем доступного ОЗУ – 360 Гб (24 Гб на узел). Объем хранилища - 80 Тб. Системное программное обеспечение включает операционные системы Scientific Linux 6 и систему управления очередями TORQUE. В качестве MiddleWare используется пакет ARC 4 (NorduGrid) и gLite 3. Управляющие узелы кластера: 2 шт. (48 процеcсорных ядра) SYS-6016T-TLF 19, 2xIntel® Xeon® Processor X5650, 2.6 GHz, 24Gb memory, 500 Gb HDD. Операционная система: Scientific Linux 6. Узел выполняет функции виртуализации для грид-сервисов.
Узел с сетевыми сервисами: SYS-5018D-MF, 2xIntel® Xeon® Processor E1220 3.0 GHz, 24Gb memory, 500 Gb HDD. Операционная система: Scientific Linux 6. Узел обслуживает сайты кластера и виртуальных организаций и выполняет роль почтового сервера.
6 шт. (144 процеcсорных ядра) SYS-6016T-TLF 19, 2xIntel® Xeon® Processor X5650, 2.6 GHz, 24Gb memory, 500 Gb HDD. Операционная система: Scientific Linux 6. Для вычислительных узлов выделен 4 Gb HDD, для временного хранения. 9 шт. (216 процеcсорных ядер). SYS-6017R-TLF 19, 2xIntel® Xeon® Processor E5-2620, 2.0 GHz, 24Gb memory, 500 Gb HDD. Операционная система: Scientific Linux 6. Для вычислительных узлов выделен 4 Gb HDD, для временного хранения. Программное обеспечение: Языки программирования: C/C++, Fortran (gcc 4), perl 5, python 2 (3). Специальные пакеты: Amber 9 (11), GROMACS 5 (с 4.5 по 5.0), NAMD 2.9, Modeller 9v8, AutoDock 4, PTEROS 1, CPMD 3, ORCA 3. Внутренняя сеть кластера построена на основе Gigabit Ethernet та Infiniband (nodes: i1, i2), внешний канал - 10 Гбит/с. |